加格达奇区位于黑龙江省西北部、大兴安岭山脉的东南坡，在内蒙古自治区鄂伦春自治旗境内。地理坐标为东经123°45′至124°26′,北纬50°09′至50°35′。南、西面和鄂伦春自旗毗邻，东、北面与松岭区接壤。总面积1359平方公里，其中林地面积90207公顷，农业用地面积129523公顷，耕地面积17467公顷，水域面积1583公顷。嫩江水系较大的一条河——甘河，由西向东在境内通过，区段长55公里。 加格达奇地处大兴安岭余脉，山势平缓，起伏不大，属低山丘陵地带。地势西北高，东南低，低山丘陵分布在城区的周围，大部分平川分布在甘河南北两岸。平均海拔为472米。平均年气温为-1.5℃,无霜期为85天至130天。年平均降水量为494.8毫米，属寒温带大陆性季风气候。春秋分明，冬长夏短。冬季气候寒冷，被称为“高寒禁区”。